その夜、親睦を深めていた一行の前から、エキドナが忽然と姿を消す――
Lan明亮的外表和外向的性格吸引了Ayi的注意，但更重要的是，当Ayi和Lan的手互相触碰时，他们实际上回到了古代日本！最初，兰的实体已经在第二次世界大战期间死亡。现在，出现在阿依面前的是一种被称为“幽灵身体”的存在。当幽灵身体遇到特定的角色时，它可以激活穿越时间的能力。在咖啡店里，越来越多的幽灵聚集在一起。在对过去的渴望和悲伤中，兰和阿依产生了一种超越时空的爱。
彼らに対抗できるのは、「ペルソナ」と呼ばれる特殊能力を持つ者たちだけだった。私立月光館学園に転校してきた結城理はペルソナの力に目覚め、同じペルソナ使いたちで構成される特別課外活動部に引き入れられる。しかし、部員たちはそれぞれの理由で影時間の真相を追う中、想像を絶する運命と対峙することになる。
