故事内容延续第一部TV版攻壳机动队STAND ALONE COMPLEX的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。 这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
易文秀虎（钟代达雅饰演）多年来一直在用残忍的手段进行斗争。七十岁时，秀虎计划将他的家庭分成三部分，由三个儿子接管权力。他召集小虎太郎（Terao Cong饰演）、正虎次郎（Shiba Genjin饰演）和知虎三郎（Ryodasuke饰演）来到前线，并用“箭会断，砚箭永远不会断”的比喻警告三兄弟，指示他们同甘共苦。当场，三郎在膝盖上折断了三支箭，抗议父亲在不了解人性的情况下忽视了混乱的时代。秀虎大怒，将三郎驱逐出境。三郎后来去了一个邻国，成为了他的女婿。在那之后，作家确实受到了三郎岩的警告，这一背信弃义的警告成真了。父亲、儿子和兄弟之间的混乱开始了，他们将面临什么样的命运？
