11岁时，一个名叫Ashikaga Taichi（藤田淑子配音）的小男孩与他的朋友石田大和（Kazuma Yuko配音）、武内空子（Mizuya Yuko配音。然而，他出乎意料地神秘地被带到了一个五彩缤纷的数字世界。在那里，他们找到了一个叫“数码宝贝”的伙伴。进入数字世界后，八神太乙和他的同伴们遇到了凶猛的怪物贝壳兽。就在所有人都快要被抓住的时候，太一的古老野兽突然进化成了霸王龙并救了他们。进化究竟是如何对事件做出反应的？什么是数字世界？无数的谜团出现在被选中的孩子面前，激动人心的冒险就这样开始了
从小就不同于普通人的平崎一护（藤仓太饰演），机缘巧合之下遇到了女死神“腐木露琪雅”（杉崎花饰演）。露西娅是灵魂收割者之一，她将灵魂从现实世界引导到尸魂王国。他们一直在与这些怪物战斗，以保护人类免受“虚空”的伤害。
武藏只能把自己的梦想藏在心里，直到有一天他遇到了人类被鬼魂残忍杀害的场景。武藏为了重新获得与小次郎的誓言，挑战了强大的鬼魂！
