被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”,并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。高中女孩吉冈双叶(本田翼 饰)刻意让自己显得不修边幅,以避免成为其他女生攻击的对象,每天都不得不为此小心应付,殚精竭虑。某天,她意外重逢了曾在初中时代有过交集的男孩田中洸(东出昌大 饰)。