而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。 园咲家族的目的到底是什么？假面骑士W、菲利普神秘的过去又是什么？隐含着众多谜题，假面骑士W的战斗拉开帷幕……
早在八百年前，人类的欲望催生出21枚核心硬币。凡是得到硬币的人，必将获得巨大的力量。2011年6月，德国图林根州，鸿上基金会的会长鸿上光生（宇梶刚士 饰）率领探险队深入图林根州某森林的腹地，经过不断地勘测和挖掘，终于找到了核心硬币的埋藏点，却无意间解开了尘封数百年的封印，而且也使森林和东京的新宿发生对调。伴随着巨大的变动，无数中世纪士兵从山洞中走出，展开残酷的杀戮。偶然路过附近的火野映司（渡部秀 饰）与泉信吾（三浦凉介 饰）卷入混乱，与武士们展开战斗。在武士的身后，是有着强大能力的炼金师盖拉（酒井美纪 饰），她复活后发誓成为成为新世界的主宰——奥兹（OOO）。 混乱中，所有的人都被卷入德川八代将军吉宗（松平健 饰）所在的江户时代……
在一个漆黑的夜晚，一名间谍悄悄潜入日本警察局，从记录了各间谍机构重要数据的绝密文件中窃取了绝密数据。日本警方和联邦调查局特工赤井水一（池田秀树配音）立即追捕这名间谍。最后，逃犯的车从悬崖上掉了下来。
