《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，人类正式开始进出宇宙2世纪，但因为2次大型陨石的坠下，人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年，第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。
然而，看似拥有一切美好的天马，却逐渐感到良心上的不安。他亲眼目睹了医院为了拯救重要人物而忽视了危重的普通人。死者家属的指责和眼泪让天马遭受了巨大的痛苦。当这种困境再次来临时，天马果断选择营救一名头部中弹的男孩。他牺牲了自己的事业和爱情来换取一个可怕怪物的复活。在接下来的几年里，天马和怪物约翰斗智斗勇，一段尘封已久的历史慢慢被揭开。。。这部电影是根据日本漫画家浦泽直树的同名原作改编的。
某日，三个女孩在进行了一天美美的约会之后散场回家，麻美因为弯腰去捡掉在马路上的餐巾纸而遭遇了车祸。 当麻美恢复意识时，发现自己来到了一个纯白的空间中，这里只有一位前台（升野英知 饰），前台告诉麻美她已经死了。现在的麻美有两个选择，一是转世投胎，成为在危地马拉生活的食蚁兽，另一个是投胎回到婴儿时期自己自己身体里，再活一遍，积累阴德，以换取能够转世投胎成人的机会。
