市建龙园高级中学又迎来了一个和平祥和的日子。一位名叫Lumu Yuan（由Yumu Bi配音）的大二女生和她的朋友Sayega美树（由Hidamura秀吉配音）和仁美智珠（由Shinagai Ryoko配音）讨论浪漫话题，享受年轻女孩的快乐青春。就在这时，一个叫小美彦（斋藤千和配音）的新生来到了班上，这个带着一丝神秘气质的女孩让小圆相当困惑。在和Sayega一起放学回家的路上，小圆听到了一个浑身伤痕累累的未知生物的呼救声，而正是严小美在追赶它。在关键时刻，他们得到了魔法女孩巴玛米（水桥翔之配音）的帮助，巴玛米也是神奈原高中的学生，并了解到这个名叫丘比的生物有能力帮助人们成为神奇的女孩。女孩们无意中打开了通往另一个世界的大门。。。这部电影是《魔法女孩》的剧场版，分三部分上映，由电视版12集改编而成。
在过去的几百年里，月球和地球之间的关系终于缓和了，两者建立了“曼辛萨基中央联络港口城市”作为沟通渠道。浅野代也（千叶进步配音）是一个普通的年轻人，曾就读于Manshinasaki大学附属的卡特里娜学院。Daiya很小就失去了父亲，与妹妹Sayaka（本山美奈配音）和妹妹Mayi（安久信配音）过着相互依赖的生活。有一天，Sayaka告诉Daza，月亮公主要来访问地球，他们的家成了公主的临时住所。
