在10年后东牧城爆发的“圣杯之战”中，由于被称为“圣杯战争”之一的关东家首领关东脏砚的参与，这场战争变得更加变形、扭曲和恶化。作为参与战斗的宫主，卫宫侍郎也受伤了，失去了英雄Saber。然而，为了保护小樱，侍郎并没有退出战斗。而为四郎的身体感到担忧的小樱，也逃不过魔术师自己的命运
这个世界里除了巨塔Artonelico和一些浮游大陆以外几乎什么都没有。整个Soul Shell就是一个完全封闭的空间，没有天空也没有海洋。在Soul Shell中存在着两大对立的势力，“艾尔米雷米尔教会”以及“天霸”。艾尔米雷米尔教会崇拜的是诗神，他们的目标是创造理想的国度，而天霸则掌握有极高的科学技术，他们目的则是建立科学化文明社会。 在Soul Shell中还有一个贯穿整个游戏剧情的种族，这个种族名为“雷瓦提尔”，这个种族拥有将思念转化为诗篇的强大力量……
