发生在21世纪初，秋天的内浜地区。 内浜学园迎来历届最高潮的盛况。以执行部为中心举办的各文化学会最大的展示场地・综合学会。 那将是与新校舍建立的同时，决定废弃的旧校舍所举行最后狂欢节日。
在黑暗时代,妖术师果心居士唆使松永弹正夺取天下,一对青梅竹马的忍者恋人城太郎(真田广之 饰演)与篝火(渡边典子 饰演)成为了最无辜的牺牲品! 为了拯救被绑架的爱人篝火,城太郎与果心居士及其部下,展开忍术与邪术的决战..........
ちょうどその時メルフェアランドでも、この世界のクイーンズブレイドが開催されようとしていた。 アリシアは元の世界へ帰る方法を探すのだが・・・
